Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms