Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhoP15409 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhoP15409 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms