Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms