Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lcn2P11672 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lcn2P11672 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lcn2P11672 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lcn2P11672 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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