Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaraP11416 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaraP11416 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaraP11416 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaraP11416 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaraP11416 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaraP11416 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaraP11416 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaraP11416 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaraP11416 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaraP11416 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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