Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp1P11103 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms