Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CatspereP0DP43 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms