Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01643 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01643 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01643 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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