Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01641 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01641 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01641 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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