Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sp1O89090 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sp1O89090 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sp1O89090 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sp1O89090 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp1O89090 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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