Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CcnkO88874 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms