Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms