Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms