Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarce1O54941 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms