Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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