Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CrxO54751 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms