Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms