Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Prrt1O35449 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt1O35449 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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