Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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