Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smad6O35182 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms