Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms