Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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