Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms