Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm8356J3QPD3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms