Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms