Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5294J3QP53 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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