Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20795J3QP49 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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