Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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