Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc180J3QNE4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms