Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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