Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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