Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3336J3QMQ6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3336J3QMQ6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3336J3QMQ6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3336J3QMQ6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3336J3QMQ6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3336J3QMQ6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3336J3QMQ6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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