Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Taf4bG5E8Z2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf4bG5E8Z2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms