Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cldn20G5E8X0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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