Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms