Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngap1F6SEU4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms