Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm340F6RGI3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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