Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ddx60E9PZQ1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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