Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd1E9PZ26 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms