Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Srp54bE9PXC0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srp54bE9PXC0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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