Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms