Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan18E9PUD6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan18E9PUD6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms