Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc6D3YZP9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc6D3YZP9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ccdc6D3YZP9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc6D3YZP9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc6D3YZP9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ccdc6D3YZP9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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