Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms