Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms