Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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