Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spocd1B1ASB6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Spocd1B1ASB6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spocd1B1ASB6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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