Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms