Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf2A3KGV1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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