Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms